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Las plagas se pueden diferenciar según la parte de la planta a la que afecten, lo que permite además tener en cuenta el momento de su tratamiento, siempre que se supere el umbral económico de daños. Según esto, actúan insectos de suelo en semilla y plántulas, como Agriotes, Melolontha, insectos que atacan durante el desarrollo vegetativo, como Mayetiola destructoros, Zabrus tenebrioides, o los taladros, insectos de la espiga, como chinches o pulgones, y finalmente ácaros y nemátodos.
En cuanto a las enfermedades muchos hongos pueden atacar durante la germinación o primeros estados vegetativos, por lo que se transmiten por semilla, suelo o residuos de cosechas anteriores. Se puede luchar contra ellos mediante métodos culturales, partiendo de material sano y un manejo adecuado de residuos, aunque algunos ya están muy extendidos. Otros hongos pueden atacar en estado más avanzado del cultivo, por lo que es recomendable su detección precoz y seguir modelos de tratamiento.
